La Corporación Bioeficiencia tiene como misión realizar el aprovechamiento y transformación de los residuos, con el fin de reducir el acelerado agotamiento de los recursos naturales, el calentamiento global, la contaminación; generando condiciones de bienestar para sus asociados y mejorando la calidad de vida de la sociedad. Para lo cual, fundamenta sus acciones en los preceptos de la innovación, economía circular, desarrollo humano y la educación ambiental.
Para el año 2041 la Corporación Bioeficiencia será líder en la prestación de servicios públicos de amplio reconocimiento en el territorio colombiano, por su eficiente gestión e innovación en la recuperación y transformación de los residuos sólidos, con un equipo de alta calidad humana, técnica y profesional.